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NGSシーケンスサービス
シーケンスからデータ解析まで一括対応
- ■ サンプル調製「抽出、ライブラリ作成」
- サンプルはシーケンス可能な状態かチェックし、ライブラリを作成いたします。
ターゲットリシーケンス、16Sアンプリコン解析においてはDNA抽出からサポートが可能です。 - ■ シーケンス解析
- 調製を行ったサンプルを次世代シーケンサーで解析いたします。
- ■ 情報解析
- シーケンスで得られた塩基配列を解析します。シーケンス解析サービスと合わせてお申し込み頂けます。
特徴
サンプル調製からご利用いただけます
次世代シーケンサーに限らず、解析はライブラリの作成が命です。
本サービスではお客様から送付いただいたサンプルを、熟達したスタッフによるサンプル調製もメニューに組み込み、よりお手軽にシーケンス解析をご利用いただけるようになりました。
本サービスではお客様から送付いただいたサンプルを、熟達したスタッフによるサンプル調製もメニューに組み込み、よりお手軽にシーケンス解析をご利用いただけるようになりました。
シーケンス + 情報解析
シーケンスで得られるデータは塩基配列のみです。これから意味を見出すためにはITスキルを活用した独特な情報解析が必須となります。
当社のサービスでは、バイオの知識のみならずITスキルも有した解析者が豊富な実績と経験を活かし、解析をサポートいたします。
当社のサービスでは、バイオの知識のみならずITスキルも有した解析者が豊富な実績と経験を活かし、解析をサポートいたします。
シーケンススペック
Ion PGM™
| シーケンス長ピーク（bp） | リード数（/1chip） | データ量（/1chip） | 作業期間（/1chip） |
| 200 | 4-5.5 million | 600Mb-1Gb | 2カ月 |
| 400 | 4-5.5 million | 1.2-2Gb | 2カ月 |
チップや試薬に依存するため、変動することがございます。
作業期間は目安であり、サンプルの状態により多少前後することがございます。
作業期間は目安であり、サンプルの状態により多少前後することがございます。
主にサンプルのゲノムサイズと解析内容により、必要なデータ量が変化いたします。ご依頼書の内容をもとに、当社で必要なデータ量をお見積りさせていただきます。
他機種シーケンサーでの解析をご希望の場合はご相談ください。
配列データのファイル形式は一般的な「FASTQ（Phred+33）」となります。
他機種シーケンサーでの解析をご希望の場合はご相談ください。
配列データのファイル形式は一般的な「FASTQ（Phred+33）」となります。
ご依頼のフロー
| Step1 : お見積り |
| 価格、お見積よりご依頼ください。送付いただいた内容をもとに、お見積と仕様書を作成いたします。お見積のために詳しい情報が必要になった場合には、当社よりご連絡をさせていただきます。お見積りはメールにてお送りさせていただきます。その際に注文書・必要送付物リストも同封させていただきます。 |
| Step2 : サンプル送付 |
| 注文書を確認次第、サンプル送付依頼をさせていただきます。サンプルは充分量のドライアイスとともにお送りいただくことになります。 |
| Step3 : サンプル調製 |
| サンプル到着後、シーケンスが可能な状態かどうかチェックいたします。チェックを通過したサンプルはシーケンス用の調製を行います。DNA抽出から行う場合はその処理も行います。 |
| Step4 : シーケンス解析 |
| 次世代シーケンサー（NGS）を用いてシーケンス解析を行います。配列情報が得られます。 |
| Step5 : 情報解析 |
| 得られた大量配列データの計算を情報技術を用いて行います。 |
| Step6 : 解析結果送付 |
| ご注文頂いた内容に応じ、納品物を送付いたします。内訳はStep1 のご注文書に記述されているものとなります。 |
納期に関しましてはデータサイズにより変動いたします。シーケンス解析の場合は完了次第、配列データをお送りいたします。データ解析の納期に関しましては、シーケンス後に開始いたしますので、それぞれのページをご確認ください。
お見積
以下のフォームよりお問い合わせください。
これらの情報があるとスムーズです。
- サンプルの種類
（例：マウス、正常と異常） - サンプル数
- 配列解析のシーケンサーの機種やアプリケーション
（ご希望がある場合。例：Illumina MiSeq、250pb長、ペアエンド） - 配列解析の方法
（例：ChIP-Seq解析、正常と異常で比較する）