受託解析サービス

 次世代シーケンサー(NGS)の受託解析を行っております。バイオインフォマティシャンが直接実験計画をお伺いし目的に応じたプランのデザイン、作業が可能です。その他、バイオインフォマティクスに関するあらゆるご内容をご相談いただけます。

次世代シーケンサー関連サービスラインナップ

☞ シーケンス解析受託サービス
 生物種、解析手法等を考慮し、適したシーケンサーとアプリケーションをご提案いたします。また、取得したデータに合わせたデータ解析もサポートいたしますので、実験計画段階からご相談いただけます。
データ解析受託サービス
シーケンスデータの解析を行います。

∟ ☞ オーダーメイド
 シーケンスデータに合わせて一からフローを作成することで、最適な手法や、最新の手法を取り入れたデータ解析を行います。中間結果からフローの変更も可能です。
∟ ☞ パッケージサービス
 自社内所有の既存フローを使用し、低コストでデータ解析をご提供いたします。論文でよく用いられるフローをご用意しております。

次世代シーケンス解析とは

 NGSを使った研究は下記図のように「実験科学」「情報科学」の2段階に分類されます。
 「実験科学」で取得したシーケンスリードデータはビッグデータのため、「情報科学」で用いる手段は普通とは異なります。技術の発展により、データ量によっては市販のパソコンでも解析ができるようになってきましたが、現在までに開発されてきた解析ツールは解析サーバー(Linux)上で動作するものが主流です。
 また、「コマンドによる操作」を用いることになりますので「マウスポインタによる画面操作」ができません。

実績一例

解析手法

RNA-Seq解析
遺伝子発現量計算、GO(Gene Ontology)有意差検定
ReSeq解析
変異検出、構造変異、遺伝子変異計算、コンセンサス配列作成
メタゲノム解析
16SrRNA、ショットガン、細菌叢解析、環境クラスタリング
ターゲットゲノム解析
Exome、ChIP-Seq、モチーフ検索、近傍遺伝子検索
Bisulfite-Seq解析
CpGメチル化検出、メチル化率の算出
de novo解析
新規ゲノム配列決定、アセンブル、遺伝子予測

生物種

  • ヒト、マウス、ラット、ゼブラフィッシュ、他動物
  • シロイヌナズナ、イネ、他植物
  • 大腸菌、環境細菌、他細菌

その他

  • 公共データベースからのアノテーションの付加や統計解析
  • テキストデータからのExcel化、数値データのグラフ化などのデータの整形・可視化